Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms