Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp37Q8C0R0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp37Q8C0R0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms