Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpcpd1Q8C0L9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms