Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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