Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp38Q8BW70 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp38Q8BW70 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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