Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gga3Q8BMI3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gga3Q8BMI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms