Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms