Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms