Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc172Q810N9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms