Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms