Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ttc28Q80XJ3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc28Q80XJ3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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