Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Npm2Q80W85 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm2Q80W85 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm2Q80W85 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms