Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcsk9Q80W65 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms