Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lamp3Q7TST5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lamp3Q7TST5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms