Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tnfsf18Q7TS55 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tnfsf18Q7TS55 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tnfsf18Q7TS55 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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