Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms