Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scn4bQ7M729 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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