Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms