Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mindy1Q76LS9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms