Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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