Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms