Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtifQ6PEE2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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