Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms