Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms