Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NipblQ6KCD5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms