Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm4Q6IRU2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpm4Q6IRU2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms