Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms