Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms