Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sv2cQ69ZS6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sv2cQ69ZS6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sv2cQ69ZS6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sv2cQ69ZS6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Sv2cQ69ZS6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Sv2cQ69ZS6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sv2cQ69ZS6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms