Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms