Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnna3Q65CL1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms