Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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