Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gbp4Q61107 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gbp4Q61107 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gbp4Q61107 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gbp4Q61107 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gbp4Q61107 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp4Q61107 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp4Q61107 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp4Q61107 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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