Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usf1Q61069 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf1Q61069 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms