Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms