Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samhd1Q60710 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms