Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms