Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp18Q5SSI6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms