Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms