Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms