Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhox3aQ4TU90 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms