Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc27Q3V036 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc27Q3V036 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms