Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prdm6Q3UZD5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms