Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms