Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms