Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm29609Q3UU56 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29609Q3UU56 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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