Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dtx3lQ3UIR3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms