Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms