Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms