Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms